Директор НИИ карпатоведения - Прохненко Игорь Анатольевич.
Институт карпатоведения создан на базе археологической лаборатории Ужгородского государственного университета в 1992 В его состав вошли специалисты в области археологии, истории, фольклористики. В структуре Института действовали отделы археологии, этнографии и языкознания. Директорами Инcтитуту были: И.Поп (1992-94), г. Макаров (1994-2000) М.Вегеш (2000-04). С 2004 возглавлял В.Котигорошко.
В 2007 году произошла реорганизация Института, которая определила направление его исследований на изучение древней и средневековой истории населения Верхньотиського региона как части Карпато-Дунайского ареала на базе археологических исследований и данных письменных источников.
Институтом заключен ряд соглашений о приграничном сотрудничестве с учреждениями сопредельных стран (Словакия - Технический университет г.. Кошице, Институт археологии САН м. Нитра, Музей истории. Ганушовци над топят; Венгрия - Институт археологии УАН м. Будапешт; Румыния - Сату-марских уездный музей истории и искусств), что позволило лучше осветить ряд важных аспектов истории региона.
Ключевой достопримечательностью для исследований выступает археологический комплекс (городище и сакральный центр) возле с. Малая Копаня Виноградовского района, где с 1977 года проводятся раскопки горизонтов рубежа нашей эры и Х-ХI вв. На территории городища, которое является базой проведения практики для студентов I курса исторического факультета, открыты десятки производственных мастерских и сооружений и значительное количество вещевого материала I в. до н.э. - I в. н.э.
Только в сакральном центре за последние годы было обнаружено несколько тысяч индивидуальных находок. Это оружие, конская сбруя, вещи экипировка всадников, принадлежности одежды и украшения. Среди последней категории вещей необходимо отметить золотой торквес (550 гр.), Единичные аналогии которому известны только в Швеции, Дании и Ольвии.
Более того, в 2012 году на территории Малой Копани был раскопан монетный двор I в. до н.э., где чеканились дакийские номиналы. Это сооружение свидетельствует о высоком уровне экономики древнего населения на территории Украины.
В последние годы поиски проводятся и на территории замков Закарпатья (Виноградовский, Королевский, Середнянский, Квасовский, Силецкий, Броньковского и Вишковский укрепленные пункты), которые позволили поставить реперные точки возникновения и гибели памятников, а также в совокупности с данными письменных источников были определены причины возникновения монументального военного зодчества в эпоху ХИИИ - XVI вв.
Результаты полевых и лабораторных исследований сотрудников Института отражены в десятках отечественных и зарубежных статей и монографий.
Инcтитут выдает периодический сборник научных трудов "Карпатика", на сегодняшний день вышло 41 выпусков.